Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM4SF18Q96CE8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM4SF18Q96CE8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms