Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms