Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms