Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNRD1Q16881 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms