Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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COL19A1Q14993 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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