Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXC1Q12948 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXC1Q12948 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms