Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF5Q12774 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF5Q12774 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms