Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp10Q000W5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp10Q000W5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms