Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Samsn1P57725 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms