Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD4P46934 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD4P46934 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms