Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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