Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRAFP15056 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRAFP15056 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRAFP15056 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms