Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms