Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5538W4VSP6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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