Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms