Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPASTQ9UBP0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms