Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS4Q9BT78 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms