Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERPUD2Q9BSE4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms