Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms