Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPBP1Q92547 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms