Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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