Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSH2Q76I76 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSH2Q76I76 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms