Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms