Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL22Q53GT1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms