Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNRD1Q16881 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms