Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS72Q15906 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms