Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms