Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TUBB3Q13509 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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