Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOS1Q07889 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms