Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec23aQ01405 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms