Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTBN1Q01082 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms