Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms