Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms