Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX2P52951 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX2P52951 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms