Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms