Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPREP23469 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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