Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRHP20396 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRHP20396 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRHP20396 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRHP20396 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRHP20396 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRHP20396 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRHP20396 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRHP20396 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRHP20396 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRHP20396 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRHP20396 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRHP20396 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRHP20396 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRHP20396 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRHP20396 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRHP20396 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms