Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LBPP18428 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LBPP18428 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LBPP18428 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LBPP18428 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LBPP18428 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LBPP18428 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LBPP18428 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LBPP18428 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LBPP18428 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms