Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFLP07196 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFLP07196 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NEFLP07196 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms