Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GASTP01350 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GASTP01350 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GASTP01350 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms