Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E9PBE3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E9PBE3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E9PBE3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E9PBE3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms