Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA1Q9UJY5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA1Q9UJY5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms