Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NSMCE2Q96MF7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms