Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms