Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC141Q6ZP82 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms