Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GREB1Q4ZG55 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GREB1Q4ZG55 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms