Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTAN1Q13813 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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