Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CDC14B-207ENST00000463547 553 ntTSL 414.81□□□□□ -0.048e-7■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 CDC14B-205ENST00000415608 684 ntTSL 57.02□□□□□ -1.298e-7■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 CDC14B-213ENST00000496750 649 ntTSL 34.3□□□□□ -1.728e-7■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 511.28□□□□□ -0.67e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 517.37■□□□□ 0.371e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 212.71□□□□□ -0.371e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-222ENST00000546088 1728 ntTSL 36.33□□□□□ -1.41e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-206ENST00000527068 1023 ntTSL 56□□□□□ -1.451e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 34.98□□□□□ -1.611e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 24.69□□□□□ -1.661e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 24.67□□□□□ -1.661e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-215ENST00000530769 4358 ntTSL 24.59□□□□□ -1.671e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 33.79□□□□□ -1.81e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 33.73□□□□□ -1.811e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-206ENST00000421059 631 ntTSL 420.87■□□□□ 0.932e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-219ENST00000471238 600 ntTSL 317.49■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-213ENST00000448410 1104 ntTSL 315.58■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-203ENST00000412521 586 ntTSL 415.57■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 413.64□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-211ENST00000439963 625 ntTSL 413.5□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 411.89□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 410.37□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 POR-214ENST00000449920 283 ntTSL 55.45□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-7■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 XIAP-209ENST00000496602 628 ntTSL 39.52□□□□□ -0.894e-7■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-206ENST00000440225 871 ntTSL 321.84■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.827e-14■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-212ENST00000460673 471 ntTSL 419.75■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-217ENST00000497233 457 ntTSL 419.75■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-216ENST00000493322 934 ntTSL 318.75■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 FAM120A-203ENST00000427765 1710 ntTSL 1 (best)18.15■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-208ENST00000451699 703 ntTSL 418.06■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-218ENST00000520135 546 ntTSL 317.9■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 217.8■□□□□ 0.443e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-219ENST00000523306 751 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-202ENST00000417349 537 ntTSL 416.69■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 931 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.267e-14■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 MRPL21-207ENST00000565125 2283 ntTSL 516.17■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-204ENST00000431404 321 ntTSL 515.13■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-203ENST00000421980 2685 ntTSL 515.02□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-215ENST00000487288 1195 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.126e-11■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SARS2-203ENST00000455102 1118 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SARS2-213ENST00000600448 536 ntTSL 311.75□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-210ENST00000452438 563 ntTSL 411.16□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 MRPL21-201ENST00000362034 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 TAF6-207ENST00000449571 612 ntTSL 510.9□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 MRPL21-205ENST00000541279 764 ntTSL 510.12□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PRELID2-208ENST00000515161 419 ntTSL 38.82□□□□□ -12e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PRELID2-206ENST00000510594 552 ntTSL 38.31□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RPL27-204ENST00000588830 318 ntTSL 27.9□□□□□ -1.143e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RPL27-202ENST00000586277 460 ntTSL 37.67□□□□□ -1.183e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.183e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.32e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.653e-8■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 DNA2-205ENST00000478029 478 ntTSL 23.82□□□□□ -1.82e-6■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.327e-10■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 BAGE2-201ENST00000470054 1891 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.087e-10■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.261e-8■■□□□ 12
ILF3Q12906 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-8■■□□□ 12
ILF3Q12906 HP1BP3-207ENST00000419948 759 ntTSL 54.97□□□□□ -1.611e-8■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUDT4-207ENST00000550056 531 ntTSL 415.72■□□□□ 0.113e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.13e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUDT4-203ENST00000546925 569 ntTSL 411.75□□□□□ -0.533e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUDT4-204ENST00000547014 1419 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLC7A6-205ENST00000563080 1030 ntTSL 59.39□□□□□ -0.914e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.964e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.014e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLC7A6-211ENST00000566834 573 ntTSL 58.41□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.234e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.254e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 SLC7A6-210ENST00000566579 526 ntTSL 46.75□□□□□ -1.334e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.014e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.434e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 221.79■■□□□ 1.084e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.064e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ATP5A1-216ENST00000591267 460 ntTSL 521.27■■□□□ 14e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.964e-6■■□□□ 12
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 160.5 ms