Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms