Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3AP98173 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms